就两所，西安陆军学院乌鲁木齐分院和武警乌鲁木齐指挥学院。

一是在碱泉街的西安陆军学院乌鲁木齐分院。中国人民解放军乌鲁木齐陆军学院1949年11月诞生，位于新疆维吾尔自治区首府乌鲁木齐市区，王震将军首任校长和政治委员。隶属单位为兰州军区（新疆军区）。1993年2月改称西安陆军学院乌鲁木齐分院，1999年7月与兰州军区医学高等专科学校呼图壁训练大队(前身为乌鲁木齐军医学校)合并整编为乌鲁木齐陆军（军医）学院，正师级，隶属兰州军区。2004年11月学院再次撤编，12月改编为西安陆军学院乌鲁木齐边防干部训练大队，副师级，隶属新疆军区。

二是在延安路原新疆人民警察学校对面的乌鲁木齐武警指挥学校。武警乌鲁木齐指挥学院的前身是武警乌鲁木齐指挥学校，组建于1983年，是国务院、中央军委、武警总部批准的新疆唯一一所武警初级指挥学校。2006年武警部队院校编制体制调整，学院扩编为正师级单位，更名为武警乌鲁木齐指挥学院，并由原来的专科教育升格为本科教育。建院为驻新疆武警部队内卫、边防、消防、兵团指挥部、部队培养输送了大批军事人才。武警新疆总队、武警兵团指挥部所属单位90%以上的干部，是武警乌鲁木齐指挥学院毕业的学员，其中一部分已走上团职领导岗位。2017年6月，原武警工程大学、原武警乌鲁木齐指挥学院调整组建新的武警工程大学。

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